被囚禁的后半生
年1月3日，行政院代院长孔祥熙密电国民政府，请特赦张学良。1月4日，林森主持召开第二十二次国民政府委员会会议，决定对张特赦，发布命令：“张学良所处十年有期徒刑，特予赦免，仍交军事委员会严加管束。”国民政府委员会一致通过特予赦免张，仍交军事委员会严加管束。“管束”令宣告张从此失去自由，过着被幽禁之生活。徒刑有期限；交军事委员会蒋委员长严加管束，管束没有期限。莫德惠、刘哲、戢翼翘自北平应邀至南京，劝慰张学良。1月7日，蒋致书张学良，提出陕、甘军事善后办法，要旨为：东北军应集中甘肃，由张学良推荐一人率领前往；二、杨虎城或酌留若干部队在西安，使其行使绥靖职权；嘱其与顾祝同切商办法，余应照已发电令办理；并谓“请由兄手谕告虎城及各将领，勉以切实服从中央命令”；张学良致函蒋，提出解决陕、甘问题意见书，同意派人持其信函前往西安商，略谓：“甲、剿匪：一、调东北军全部驻开封、洛阳或平汉线上。……二、调虎城出洋考察养病半年，不开缺，以孙蔚如代理。……三、余（张学良）陪同墨三（顾祝同）到洛阳，最好到潼关或临潼，由启予（商震）或庞炳勋派兵陪同前往，请虎城及各军长来会商”、“乙、匪不剿：一、调虎城到甘，以何雪竹（何成濬）或刘经扶（刘峙）为西北行营主任。……二、调东北军驻豫、鄂一带整理训练，担任国防，由王树常负责，由良（张学良）帮助整理完毕，良愿去读书”。张的囚禁之地曾五次变更。1月13日，张学良在贺耀祖、戴笠陪同下，偕米春霖由南京至奉化溪口，住武岭学校内；蒋以修订之善后方案送张学良征求意见。张学良由南京乘专机往到浙江溪口雪窦山上中国旅行社招待所。1月23日，经蒋同意后，戴笠陪同李志刚至雪窦寺中国旅行社往见张学良与赵庵，张慨叹说：“蒋先生是不会让我回去的，请告诉虎城，多容忍，要团结。我估计除非全面抗日，东北军还存在，我才有可能出去，否则是不能出去的。”2月17日，国民政府令准蒋所请，张学良着予恢复公权。2月22日，王树常、莫德惠过杭州赴溪口访张学良。3月30日，于学忠赴奉化往见张学良。
年9月中秋节，张学良到妙高台过节，晚上写信给蒋介石，请求抗战。蒋要他“好好读书”。
年1月，迁移湖南郴州苏仙岭。3月，迁移湘西沅陵凤凰山。1939年11月下旬，日军进犯湖南，张又迁移贵州修文县阳明洞。
年蒋介石撤退台湾之际，杨虎城全家被杀，张学良则是先押解到台湾。张学良晚年表示，蒋原本是要枪毙他的，是蒋宋美龄求情，他不明白为何要这么对待杨虎城。他曾劝杨虎城在西安事变后出国，回国没有好处。1949年1月，蒋介石在南京宣布下野，当时于右任建议他放了张学良与杨虎城，蒋不耐烦的说，去找李宗仁，但李宗仁不知道两人关在哪里。之后蒋就下令杀掉杨虎城一家。蒋原本也想杀了张学良，而是蒋宋美龄表示，若你对张学良不利，我立刻离开台湾、公布这些事情。张学良一开始并不知道这些事，是美国公使派人抄的这些对话给他看的。
晚年
张学良移往台北就医。1961年秋，当张被解禁后，移居自行选择新建一座小别墅，在台北市北投区复兴三路70号复兴冈居所。
年，张作霖命张学良和辽宁省梨树县商会会长于文斗女儿于凤至结？？。张学良与原配夫人于凤至，生三子一女。后有情妇“赵四小姐”。
张学良久被软禁，很自然对宗教发生兴趣，他最早笃信佛教，并看一些佛经，自觉颇有心得。甚至在新竹时，还与一些佛教法师一起讨论佛法。早年在台湾山区，某次宋美龄来看他，发现他对佛教有兴趣，就说要领导张走向真理，去相信基督教，宋先感化赵四小姐成为虔诚基督徒，渐渐张自己也就相信。张早年读教会学校，据说曾受洗。1955年，张皈依基督教。
年初，在蒋家同意下，才迁入自己出资盖的两层楼房，位于台北市复兴三路70号，是他一生居住最久的地方，1964年张正式皈依基督教，受洗。依照一夫一妻规则，也为保全张学良在台湾安全，于凤至被迫提出离婚。1964年7月4日，张在台北与赵一荻正式举行婚礼。1975年4月5日，蒋介石逝世。蒋经国仍然没有释放张，是执行蒋遗志。
年10月17日，蒋经国函电宋美龄：
“……近据匪报透露共匪又放出邀请张学良返回大陆参加其父张作霖墓园重修典礼之空言此类统战邪恶匪必层出不穷谚云见怪不怪其怪自败我亦唯有作如是观耳晚秋寒意深至恳母亲起居倍加珍护肃叩福安儿”
月20日，宋美龄函电蒋经国：
“……张汉卿在东北人心中尚有其影响力此所以诡匪尚有利用者也若统战热化时汉卿默然无声则又可大做其文章余数十年中为其排难开脱说项在灵心上引介其信仰上帝再忆汉卿曾对汝痛苦流涕悔其当初铸成大错谅需要其可为我亿万大陆受难同胞作一严正表示根据事实痛斥共匪伪谲害人之毒辣对其个人亦是有利其可对中国历史有一交代且须在交代中预防匪方谓并非出诸自愿等妄言故须斥文中事前杜绝之犹如余对廖函先予预防其反击及可能滥言故对匪毒先打防疾剂也母”
月22日，蒋经国函电宋美龄：
“……关于共匪企图邀请张学良返回大陆参加张作霖墓园重修仪式之说系香港匪文汇报十月十日转载匪英文中国日报试探性之消息目前匪尚无进一步之动作而张学良亦尚一无所知大人所示当依情况发展谋求对策专肃奉禀敬叩福安儿”
赴美
年1月13日，蒋经国逝世。李登辉继任中华民国总统，初期未有改变软禁张学良政策，直到1990年将其释放。1990年6月1日，台湾各界人士为张重获自由并于圆山饭店九十寿辰举行隆重庆祝，在当时接受访问，他说道，自己虚度了90年、对国家社会人民毫无建树，惭愧万分，哪有什么寿可以做，他还引述圣经暗示自己是罪人之魁。1991年3月10日，张携夫人赴美国探访亲友。6月初，返回台北。1993年4月，受聘为东北大学名誉校长，5月受聘为哈尔滨工业大学名誉理事长。1993年12月15日，张学良夫妇定居夏威夷。1994年获得绿卡，长居夏威夷。2000年6月22日，赵一荻夫人逝世，享年八十八岁。
逝世
年10月14日14时50分（北京时间10月15日8时50分），在美国夏威夷首府檀香山史特劳比医院逝世，享年100岁。张虽然长寿，却始终没有回中国东北老家，有的归咎于身体原因，也有归咎两岸关系的政治原因。