平乱
苗傅和刘正彦当政后，想要改元及迁都金陵，太后和朱胜非担心若两件事都不答应会惹恼苗傅，只好答应改年号为明受，并以金陵靠近江北难以防御金兵为由婉拒迁都。 朱胜非知道苗、刘见识短浅，不难对付，便周旋于叛军和太后之间，迷惑苗傅，使自己取得了单独面见太后的权利，又试图策反苗傅的手下王世修、王钧甫等。 苗傅掌权后不久，贬宦官曾择、蓝珪到岭南，并派杀手在半路上斩杀曾择。 又企图以所部士兵代替禁军守卫睿圣宫，甚至想邀高宗游览南方，都被张澄、朱胜非巧妙地阻止。
几天后，驻防平江的张浚接到大赦的命令，知道情势有变 并通知驻守吴江的张俊起兵会合。 驻防江宁的吕颐浩也得到消息，和部属讨论后确定为兵变，当即决定讨伐，一方面派遣使者回杭州安抚叛军，一方面写信通知张浚和刘光世政变消息。
张浚当即在平江起兵，约刘光世和吕颐浩率兵到此会合，同时派冯轓到杭州劝苗、刘让高宗复位，迷惑叛军，也派遣从杭州逃出来的保义郎甄援到刘光世、韩世忠军中宣传起兵的消息。 韩世忠和张俊也先后率兵至平江，听候张浚调遣。张浚得到部属要断吴江桥反叛的密报，派韩世忠率部进至秀州阻止。 苗傅得到消息后，打算扣押韩世忠的妻子梁氏及儿子为人质，朱胜非表示只要派这两人到平江安抚韩世忠，事情就可解决，苗傅竟答应了他的建议。朱胜非不禁私自暗喜苗傅的愚蠢。
冯轓回到平江后，张浚再度派他到杭州和苗、刘等声明大义，苗傅曾听说张浚已经集结重兵，但不相信，这时才惊觉已经遭到讨伐，诏贬张浚为黄州团练副使、郴州安置，御史中丞郑瑴上书为张浚开脱，又遣人密报张浚放慢行军速度，使叛军自行垮台。
叛军派苗瑀和马柔吉率赤心军及王渊旧部驻扎临平抵挡勤王军，冯轓也入城内和苗傅商议，苗傅要拘留他，张浚得知后便伪造了一封书信给冯轓，内容是表述苗、刘是忠于朝廷的，且故意被苗傅拦截下来，苗傅看了张浚给冯轓的信后，信以为真，便放了冯轓。
隔天，张浚得到了被贬的消息，随即和刘光世、张俊、韩世忠联名传檄天下勤王，从平江大举出发声讨苗刘。
高宗复位
苗刘闻讯大为惊恐，被迫接受朱胜非和冯轓的提议，率百官奏请高宗复辟。 高宗还宫后，诏尊太后为隆佑皇太后，恢复苗傅策立的幼君赵旉为太子，且故意任命苗傅为淮西制置使，刘正彦为淮西制置副使，将他们引出朝廷，隔天下诏恢复年号建炎。 苗、刘二人要求高宗赐予免死的铁券，免于追究他们政变的责任，“傅、正彦见帝，请设盟誓，两不相害。帝赐金劳遣。傅、正彦退诣都堂，趣赐铁券，胜非命所属检详故事，如法制造”（续资治通鉴卷一百五）【或云高宗知道两人学识不丰，在铁券上写着“除大逆外，余皆不论”，苗刘不察，以为安全了。此事史无记载，乃后人附会之说。太后与高宗居叛军之中，朝不保夕，为了安抚苗刘，两赐铁券，手诏韩世忠称许苗刘，甚至与苗刘盟誓。高宗不至于此时在铁券上另书文字，使苗刘生疑。铁券必然造的如法。三月癸卯，太后诏：“御营都统制苗傅、副都统制刘正彦并赐铁券”。三月丁未，“上乃赐韩世忠手诏曰：知卿已到秀州，远来不易。朕居此极安宁。苗傅、刘正彦本为宗社，始终可嘉。卿宜知此意，遍谕诸将，务为协和，以安国家”。夏四月戊申朔下诏曰：“所有三月六日赦书应干恩赏等事，令有司疾速施行。敢有稽违，重寘典宪”（见建炎以来系年要录卷二十一、二十二）】 当天，勤王军到达叛军驻扎的临平，韩世忠率前锋力战，大破叛军苗翊与马柔吉，挺进北关。苗、刘二人率精锐两千人，拿着高宗所敕赐铁券逃出杭州，同时命令手下纵火，但天降大雨，火不能起。
后续
勤王军刘光世、张浚、韩世忠、张俊、吕颐浩等入城，高宗握住韩世忠的手痛哭，并请求他除掉看守宫门、私通叛军的吴湛，韩世忠随即上前，装作要和吴湛谈话，折其中指将他逮捕，诏斩于市。 高宗也下诏表示只追究苗傅、刘正彦、王钧甫、马柔吉、张逵等的责任，其他军官士兵皆不追究，于是赤心军背叛苗傅，王钧甫想率军投降，但其部下张翼等其人斩了王钧甫、马柔吉投降。 王世修则是接受审判后斩于市。
苗傅、刘正彦两人率军逃亡，侵犯许多郡县。刘正彦在浦城乘胜追击官军时被韩世忠擒获，苗翊为部下所擒来献，张逵率残兵败降遁入崇安，也被韩世忠派军追而杀之。
苗傅则变更姓名，在逃亡建阳时被发现，押送至韩世忠处。 于是韩世忠宣布班师，俘苗傅、刘正彦、苗翊三人以献，两人在建康被磔弃市。 刘正彦在行刑时还大骂苗傅不用自己的计策，因而失败。
高宗封赏平乱功臣，升吕颐浩为尚书右仆射；升李邴为尚书右丞；封韩世忠为少保、武胜、昭庆两镇节度使，御书“忠勇”赞扬其忠心，另外封其夫人梁氏为护国夫人。武将兼两镇节度使及功臣之妻受封赏皆始于此。张浚则自请前往川陕一带防守，被封为宣抚处置使。
另外，高宗追赠王渊开府仪同三司，追康履“荣节”谥号。 韩世忠因在卑微时曾受王渊赏识，此时知恩图报安葬了王渊，为他料理身后事。
影响
宋高宗本来就惧怕地方武力和将领拥兵坐大，这次的政变成了他心中挥之不去的阴影，使他终其一生都不再信任武将。他频繁调度将领，达到“兵不识将，将不识兵”的目的，使南宋重文轻武的情形加剧。苗傅拿“徽钦”二帝仍在北方来质疑高宗皇位的正统性，以此为主要理由要求高宗退位，加深了高宗对此事的忧惧，对他往后排斥北伐、倾向与金朝和议保持半壁江山也有一定程度的影响。