元至正二十六年四月，占据泉州的亦思巴奚头目那兀纳命他的部将白牌、马合谋、金阿里等攻兴化柳伯顺。陈友定派兵增援柳伯顺，与城中的柳伯顺军夹击亦思巴奚军。亦思巴奚军大败。陈友定乘机发兵进击泉州，五月攻入泉州，擒杀那兀纳，大肆杀色目人，挖掘蒲氏诸冢，致使大批穆斯林逃离泉州。同年八月戊寅，元朝“以李国凤为中书左丞，陈有定为福建行省平章政事。”（《元史?顺帝》）友定既为平章后，势力大增，“数招致文学知名士如闽县郑定、庐州王翰之属，留置幕府，友定遂粗涉文史。然颇任威福，所属违令者，辄承制诛窜不绝。”（《元史?本纪三十七》）漳州总管罗良曾以书指责友定：“今郡邑之长，君命也，固不可以加害；百司之职，君役也，固不可以加窜。足下破郡邑为家资，驱官僚为臣妾，口言为国，心实私耳。”（《龙飞纪略》）为了巩固自己的势力，陈友定一方面用武力铲除异已者， “益发兵攻之，罗良巷战死之，友定遂据漳州。元福建宣慰使陈瑞孙镇守福清州，不服友定，被执，瑞孙愤骂不已，遇害，其妻及幼女皆投井死。崇安令孔楷，因拒友定亦遇害。建阳詹斡结兵自保，不从友定，亦遇害”。不久，陈友定已“据全闽，八郡之政，皆用其私人以总制之。朝廷命官不得有所与。”（《元史·迭里弥实传》）另一方面，陈友定为了表示对元政权的忠心，尽管福建通往元朝大都（今北京）的陆路被农民起义军切断，他还是千方百计派兵护卫，由海路经登、莱等州，每年给大都运去大批粮食等物质；因此，他得到了元朝的嘉奖。翌年，陈友定为了防御朱元璋入闽，修缮连城冠豸寨，凿开清流九龙滩，以通舟楫。
元至正二十七年十月，朱元璋平定方国珍的割据势力后，开始制定对福建的用兵方略。朱元璋采用水陆两路包围夹击的战术，消灭陈友定的割据势力。同年十二月，陆路由中书平章胡廷瑞为征南将军、江西行省左丞何文辉为副将军，率领安吉、宁国、南昌、袁州、赣州等地卫军经杉关入闽，直取邵武、建阳。水路由汤和为征南将军，“遂与副将军廖永忠率舟师自明州(今浙江宁波)取海道入福建。”朱元璋的部队势如破竹相继攻陷邵武、建阳、崇武、浦城等地，陈友定的守将或降或战死。汤和部迅速包围了福州。陈友定分兵对抗。据《续资治通鉴》载：“初，陈友定环城外筑垒为备，每五十步更筑一台，严兵守之。闻吴军入杉关，乃留同佥赖正孙、副枢谢英辅、院判邓益以众二万守福州，自率精锐守延平，以相掎角。”汤和率军抵达福州后，入五虎门，驻师南台河口，迅速包围了福州。汤和曾派使者入城招降，平章库春杀了使者，领兵出南门迎战，被汤和的部将指挥谢德成等杀得大败，“众溃，入城拒守。” “是夜，参政袁仁密遣人纳款，吴师于台上蚁附登城，遂开南门。和拥兵入，邓益拒战于水门，和击杀之。赖正孙、英辅自西门出走延平，库春等皆怀印绶、挈妻子遁去，参政尹克仁赴水死，行宣政院使多尔玛不屈，下狱死。时佥院拜特穆尔居侯官，闻吴军攻城急，叹曰：‘战守非我得为，无以报国！’乃积薪楼下，杀其妻、妾及二女，纵火焚之，遂自刎。”（《续资治通鉴》）
洪武元年（1368）正月，朱元璋即皇帝位，国号大明，建元洪武；同期，汤和部占领福州后，挥兵南下，与胡廷瑞部会师，围攻孤城延平。明军派使者入城招降。“友定置酒大会诸将及宾客，杀吴使者，沥其血酒甕中，与众酌饮之，誓于众曰：‘吾曹并受朝廷厚恩，有不以死拒者，身磔，妻子戮！’遂往巡视福州，严兵为拒守计。”（《续资治通鉴》）明军以汤和部隔水布阵，廖永忠率部攻西门。陈友定的方略是“敌兵锐，难于争锋，不如持久困之。”可是，他的许多将领都认为死守不是办法，多次请求主动出击，均被陈友定制止。兵临城下的局势也使陈友定部军心不稳，内部相互间的猜妒心理加重。陈友定怀疑其部将萧院判、刘守仁有贰心，杀了萧院判，夺了刘守仁的兵权。刘守仁被迫投降明军。许多士卒见军中已发生内乱，无心守城，纷纷乘着夜色逾城逃亡。当晚，军械库发生火灾，“城中炮声震地”。明将见城中已乱，加紧攻城。陈友定见大势已去，与枢密副使谢英辅、参政文殊海牙诀别，说：“如今，大势已去，你们须努力保卫国家，我只能为元朝而死！”说完，退入省堂，服毒药自尽。谢英辅与元将白哈麻自缢。赖正孙等人开城投降。明军入城时，陈友定没有气绝，反而被雨水一淋，苏醒过来。明军将他捆绑了，押送京都处死。陈友定的儿子陈宗海领兵前来救援，也被俘虏，一同押送往京城。朱元璋斥责陈友定说：“元纲不振，海内土崩，天命更革，岂人力所能为。尔窃据偏隅，负固逆命，害吾参军，杀吾使者，陆梁弗服，欲何为哉！”友定回答说：“事败身亡，惟有死耳，尚何言！”父子均被处死。
同年二月，明军先后攻取了兴化、泉州、漳州、潮州等地。陈友定的余部虽然在金子隆、冯谷保等率领下在将乐、清流、宁化等地据山寨进行反抗，但已无济于事，至同年七月，相继被明军剿平。
元至正二十七年十月，朱元璋平定方国珍的割据势力后，开始制定对福建的用兵方略。朱元璋采用水陆两路包围夹击的战术，消灭陈友定的割据势力。同年十二月，陆路由中书平章胡廷瑞为征南将军、江西行省左丞何文辉为副将军，率领安吉、宁国、南昌、袁州、赣州等地卫军经杉关入闽，直取邵武、建阳。水路由汤和为征南将军，“遂与副将军廖永忠率舟师自明州(今浙江宁波)取海道入福建。”朱元璋的部队势如破竹相继攻陷邵武、建阳、崇武、浦城等地，陈友定的守将或降或战死。汤和部迅速包围了福州。陈友定分兵对抗。据《续资治通鉴》载：“初，陈友定环城外筑垒为备，每五十步更筑一台，严兵守之。闻吴军入杉关，乃留同佥赖正孙、副枢谢英辅、院判邓益以众二万守福州，自率精锐守延平，以相掎角。”汤和率军抵达福州后，入五虎门，驻师南台河口，迅速包围了福州。汤和曾派使者入城招降，平章库春杀了使者，领兵出南门迎战，被汤和的部将指挥谢德成等杀得大败，“众溃，入城拒守。” “是夜，参政袁仁密遣人纳款，吴师于台上蚁附登城，遂开南门。和拥兵入，邓益拒战于水门，和击杀之。赖正孙、英辅自西门出走延平，库春等皆怀印绶、挈妻子遁去，参政尹克仁赴水死，行宣政院使多尔玛不屈，下狱死。时佥院拜特穆尔居侯官，闻吴军攻城急，叹曰：‘战守非我得为，无以报国！’乃积薪楼下，杀其妻、妾及二女，纵火焚之，遂自刎。”（《续资治通鉴》）
洪武元年（1368）正月，朱元璋即皇帝位，国号大明，建元洪武；同期，汤和部占领福州后，挥兵南下，与胡廷瑞部会师，围攻孤城延平。明军派使者入城招降。“友定置酒大会诸将及宾客，杀吴使者，沥其血酒甕中，与众酌饮之，誓于众曰：‘吾曹并受朝廷厚恩，有不以死拒者，身磔，妻子戮！’遂往巡视福州，严兵为拒守计。”（《续资治通鉴》）明军以汤和部隔水布阵，廖永忠率部攻西门。陈友定的方略是“敌兵锐，难于争锋，不如持久困之。”可是，他的许多将领都认为死守不是办法，多次请求主动出击，均被陈友定制止。兵临城下的局势也使陈友定部军心不稳，内部相互间的猜妒心理加重。陈友定怀疑其部将萧院判、刘守仁有贰心，杀了萧院判，夺了刘守仁的兵权。刘守仁被迫投降明军。许多士卒见军中已发生内乱，无心守城，纷纷乘着夜色逾城逃亡。当晚，军械库发生火灾，“城中炮声震地”。明将见城中已乱，加紧攻城。陈友定见大势已去，与枢密副使谢英辅、参政文殊海牙诀别，说：“如今，大势已去，你们须努力保卫国家，我只能为元朝而死！”说完，退入省堂，服毒药自尽。谢英辅与元将白哈麻自缢。赖正孙等人开城投降。明军入城时，陈友定没有气绝，反而被雨水一淋，苏醒过来。明军将他捆绑了，押送京都处死。陈友定的儿子陈宗海领兵前来救援，也被俘虏，一同押送往京城。朱元璋斥责陈友定说：“元纲不振，海内土崩，天命更革，岂人力所能为。尔窃据偏隅，负固逆命，害吾参军，杀吾使者，陆梁弗服，欲何为哉！”友定回答说：“事败身亡，惟有死耳，尚何言！”父子均被处死。
同年二月，明军先后攻取了兴化、泉州、漳州、潮州等地。陈友定的余部虽然在金子隆、冯谷保等率领下在将乐、清流、宁化等地据山寨进行反抗，但已无济于事，至同年七月，相继被明军剿平。